El Área de Uso Científico bajo Protección Especial Islas Cormorán y Justicia fue creada en el año 1990 bajo jurisdicción provincial. El objeto de su creación es la protección y conservación de las diferentes especies, tanto de aves como de cetáceos, que se encuentran en el área.

En la isla Justicia, también conocida como isla de los Pájaros, anida el cormorán imperial, el cormorán de cuello negro o roquero, el biguá, la gaviota cocinera, la gaviota austral y la gaviotín golondrina, entre otras aves. Es un lugar de interés geomorfológico y paleontológico por la gran cantidad de mega y microfósiles que se encuentran en depósitos terciarios y por la presencia de restos de un bosque petrificado del jurásico. La isla es también un sitio de importancia histórica y cultural. Allí fue ejecutado uno de los amotinados durante el viaje de Hernando de Magallanes en 1520. Fue además recorrida por personas destacadas como Fitz Roy y Charles Darwin.

En la isla Cormorán, también conocida como isla de los Pingüinos, se encuentran distintas aves como el biguá, la paloma antártica, el ostrero negro y gaviotas y gaviotines, entre otras. Se destaca por una colonia de más de 120.000 individuos del pingüino de Magallanes.

Entre las islas, se suele observar a la tonina overa que utiliza las aguas circundantes como sitio de cría.