La Reserva del Puerto de Mar del Plata corresponde a un humedal de aproximadamente 32 hectáreas, ubicada en el extremo sur del puerto de Mar del Plata. A pesar de su pequeño tamaño, el área registra la mayor biodiversidad de todo el partido de General Pueyrredón. El humedal es hábitat de diversas especies de aves, peces, anfibios, reptiles y mamíferos. El grupo mejor representado es el de las aves, con más de 172 especies registradas. Entre las más características, podemos mencionar al cisne de cuello negro y el cisne coscoroba y una de las más vistosas y raras, el federal. En la reserva es posible observar también especies amenazadas según criterios IUCN, como la gaviota cangrejera y el espartillero enano. La conservación de numerosas especies de aves migratorias y de aves acuáticas autóctonas, depende de la subsistencia de las lagunas existentes en el área, ya que a través de estudios científicos se ha determinado la real importancia de este sector litoral para el sostenimiento del sistema costero de aves migratorias.

La reserva está rodeada de áreas urbanizadas, fabriles y turístico-recreativas asociadas al complejo de Punta Mogotes. Constituye así un espacio de encuentro entre espacios de actividades humanas intensas y un entorno natural con diversidad de fauna y flora típica de los humedales. Su inmediatez con la ciudad de la un alto valor para el desarrollo de actividades educativas e interpretativas, siendo un lugar de fácil acceso para los grupos de educación formal y no formal. Todos los años concurren a la reserva no solo delegaciones de colegios de Mar del Plata y la zona, sino también de Capital Federal y el interior del país que solicitan conocer el ecosistema del humedal portuario.

La conservación de este paisaje natural depende de la adecuada administración y gobernanza del AMP. Esto implica una gestión integrada y articulada entre las autoridades con responsabilidad en administrar conservación (OPDS y Prefectura Naval Argentina dado que el área se localiza dentro de su jurisdicción por ordenanza 12/1998), turismo, ciencia, educación y los actores privados con intereses en el área.

Las presiones y amenazas más intensas a la biodiversidad marina se relacionan con el uso turístico y con la contamincación (basura y descargas cloacales). La cercanía de emprendimientos como balnearios privados y un club deportivo, requiere especial atención por parte de las autoridades y responsabilidad por parte de los operadores de estos espacios privados, para evitar impactos directos e indirectos de estas actividades sobre el ambiente y la biodiversidad de la reserva.